Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms