Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDP1Q9P0J1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PDP1Q9P0J1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms