Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FBXL12Q9NXK8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FBXL12Q9NXK8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms