Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC28Q9NX36 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms