Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EMILIN3Q9NT22 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms