Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms