Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms