Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms