Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDE7BQ9NP56 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms