Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRHQ9HD43 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms