Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms