Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms