Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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