Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SETD2Q9BYW2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms