Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SNHG12Q9BXW3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms