Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK-6Q9BXR3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms