Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2Q9BX26 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms