Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms