Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms