Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms