Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HINFPQ9BQA5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms