Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX18Q96RF0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms