Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCNAQ96QF7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms