Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms