Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms