Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL15Q96M94 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms