Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC45A3Q96JT2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms