Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms