Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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USP9XQ93008 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP9XQ93008 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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