Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOBEC4Q8WW27 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms