Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJA4Q8WW22 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms