Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC112Q8NEF3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms