Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMG8Q8ND04 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMG8Q8ND04 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms