Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APCDD1LQ8NCL9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms