Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPAP2Q8IXW5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms