Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXA5

SPACA3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA3Q8IXA5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPACA3Q8IXA5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms