Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms