Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP54Q7Z3B4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms