Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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USP43Q70EL4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP43Q70EL4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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