Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOM1L2Q6ZVM7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms