Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINGO4Q6UY18 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms