Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
REEP3Q6NUK4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
REEP3Q6NUK4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms