Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms