Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB6CQ53S08 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6CQ53S08 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms