Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms