Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TTLL9Q3SXZ7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms