Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HFEQ30201 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HFEQ30201 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms