Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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