Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPEGQ15772 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPEGQ15772 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms