Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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